【职称】副教授，硕士生导师
【学位/学历】
2016/09-2020/10，研究生学历 博士学位
2012/09-2016/07，本科学历 学士学位
【学习经历】
2016/09-2020/10，香港大学生物科学学院 生物信息及系统生物学
2012/09-2016/07，黄播
生命科学学院 生物技术
【工作经历】
2020/12-2023/12 香港大学李嘉诚医学院 生物医药技术国家重点实验室 博士后
2020/09-2024/02 德国莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所 微生物组动力学部 访问学者
【研究方向及兴趣】
长期从事生物信息学及多组学联合分析研究（宏基因组、代谢组、脂质组、蛋白质组等）。依托所在研究团队所建立的华南地区前瞻性自然人群队列，聚焦于“代谢综合征的早期防治”核心科学问题，综合性探索“营养代谢-肠道菌群-宿主代谢健康”之间的动态联系，致力于（1）筛选代谢综合征的新型生物标志物；（2）发现关键致病通路及分子机制；（3）构建代谢综合征早期风险预测模型。
【论文代表作（近五年）】
１. Chen J*, Siliceo SL*, Ni Y, Nielsen HB, Xu A#, Panagiotou G#. Identification of robust and generalizable biomarkers for microbiome-based stratification in lifestyle interventions. Microbiome. 2023 Aug 8;11(1):178. (IF=15.5)
２. Chen J*, McIlroy SE*, Archana A, Baker DM#, Panagiotou G#. A pollution gradient contributes to the taxonomic, functional, and resistome diversity of microbial communities in marine sediments. Microbiome. 2019 Dec;7:1-2. (IF=15.5)
３. Chen J*, Lu RS*, Diaz-Canestro C, Song E, Jia X, Liu Y, Wang C, Cheung CK, Panagiotou G, Xu A#. Distinct changes in serum metabolites and lipid species in the onset and progression of NAFLD in Obese Chinese. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2024 Dec 1;23:791-800. (IF=6.0)
４. Seelbinder B*, Chen J*, Brunke S, Vazquez-Uribe R, Santhaman R, Meyer AC, de Oliveira Lino FS, Chan KF, Loos D, Imamovic L, Tsang CC, Panagiotou G#. Antibiotics create a shift from mutualism to competition in human gut communities with a longer-lasting impact on fungi than bacteria. Microbiome. 2020 Dec;8:1-20. (IF=15.5)
５. Wang Y*, Chen J*, Ni Y, Liu Y, Gao X, Ma Tse, Panagiotou G#, Xu A#. Exercise-changed gut mycobiome as a potential contributor to metabolic benefits in diabetes prevention: an integrative multi-omics study. Gut Microbes. 2024 Dec 16(1). (IF=12.2)
６. Nie X*, Chen J*, Ma X, Ni Y, Shen Y, Yu H, Panagiotou G#, Bao Y#. A metagenome-wide association study of gut microbiome and visceral fat accumulation. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2020 Jan 1;18:2596-609. (IF=6.0)
7. Zhang L*, Li H*, Sun F, Wu Q, Jin L, Xu A, Chen J#, Yang R#. Identification of novel markers for neuroblastoma immunoclustering using machine learning. Frontiers in Immunology. 2024 Nov 4;15:1446273. (IF = 5.7)
8. Diaz-Canestro C*, Chen J*, Liu Y, Han H, Wang Y, Honore E, Lee CH, Lam KS, Tse MA, Xu A#. A machine-learning algorithm integrating baseline serum proteomic signatures predicts exercise responsiveness in overweight males with prediabetes. Cell Reports Medicine. 2023 Feb 21;4(2). (IF=14.3)
9. Jia X*, Song E*, Liu Y, Chen J, Wan P, Hu Y, Ye D, Chakrabarti S, Mahajan H, George J, Yan S, Xu A#. Identification and multicentric validation of soluble CDCP1 as a robust serological biomarker for risk stratification of NASH in obese Chinese. Cell Reports Medicine. 2023 Nov 21;4(11). (IF=14.3)
10. Xu L*, Mcllroy SE*, Ni Y, Guibert I, Chen J, Rocha U, Baker D#, Panagiotou G#. Chemical pollution drives taxonomic and functional shifts in marine sediment microbiome, influencing benthic metazoans. ISME Communications. 2025 Feb 13: ycae141. (IF = 5.1)
11. Zhang F*, Lo EKK*, Chen J, Wang K, Felicianna, Ismaiah MJ, Leung HKM, Zhao D#, Lee JCY#, El-Nerzami H#. Probiotic mixture ameliorates a diet-induced MASLD/MASH murine model through the regulation of hepatic lipid metabolism and the gut microbiome. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2024 April 4: 72(15). (IF = 5.7)
【参编论著】
１. Chen J*, Wang Y, Xu A, Panagiotou G. The human gut mycobiome and its potential as a regulator of the host's metabolic health. Human and Animal Relationships. 2024 Nov 24: pp. 121-133
【研究项目】
1. 2023年度香港医疗卫生研究基金（HMRF），“Mapping the human gut mycobiome for the metabolic benefits of exercise in diabetes prevention”，130万元，在研，第二参与人
2. 黄播
引进人才基本启动经费，主持
3. 国家自然科学基因青年科学基金项目，“Eubacterium eligens菌调控肝脏组织胰岛素抵抗延缓代谢性脂肪肝病进展的作用及其机制研究”， 30万元，在研，主持
【获奖情况】
1. 2020年11月，medac医学研究奖，Lebniz-HKI，第二获奖人
2. 2016年-2020年，香港大学研究生奖学金
【社会兼职】
1. Computational and Structural Biotechnology Journal、Frontiers in Cellular and Infection Microbiology等杂志审稿人
2. 中国病理生理学会内分泌与代谢专委会会员
2. 中国营养学会组学分会委员
